O processo de alteração do Programa de Ação do PNPOT, foi promovido pela Direção-Geral do Território, e contou com a coordenação científica pela Professora Teresa Sá Marques, geógrafa da Faculdade de Letras da Universidade do Porto.
Dispôs de uma vasta equipa técnica que integrou membros de diversos organismos tutelados pelo Ministério do Ambiente (onde se inclui Comissões de Coordenação e Desenvolvimento Regional, a Agência Portuguesa do Ambiente, o Instituto de Conservação da Natureza e das Florestas, o Instituto da Habitação e da Reabilitação Urbana e o Instituto da Mobilidade e dos Transportes), bem como do Centro de Estudos de Geografia e Ordenamento do Território da Faculdade de Letras da Universidade do Porto e consultores especialistas.